Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms