Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms