Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx3P50481 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms