Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LtbrP50284 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LtbrP50284 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms