Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CitP49025 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CitP49025 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CitP49025 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CitP49025 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms