Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms