Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf9P41274 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms