Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfamP40630 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TfamP40630 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TfamP40630 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TfamP40630 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TfamP40630 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TfamP40630 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TfamP40630 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TfamP40630 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TfamP40630 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TfamP40630 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TfamP40630 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TfamP40630 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms