Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chd1P40201 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chd1P40201 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd1P40201 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd1P40201 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms