Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms