Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnd1P30999 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms