Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msr1P30204 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msr1P30204 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms