Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BgnP28653 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BgnP28653 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BgnP28653 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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