Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms