Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms