Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lef1P27782 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lef1P27782 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms