Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkchP23298 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkchP23298 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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