Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcb1aP21447 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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