Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bmp4P21275 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms