Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BdnfP21237 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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BdnfP21237 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BdnfP21237 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms