Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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