Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms