Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F2P19221 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F2P19221 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F2P19221 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F2P19221 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms