Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RargP18911 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RargP18911 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RargP18911 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RargP18911 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RargP18911 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RargP18911 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms