Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms