Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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