Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms