Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtcP11725 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtcP11725 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtcP11725 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtcP11725 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtcP11725 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtcP11725 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
OtcP11725 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms