Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms