Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Zfp28P10078 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Zfp28P10078 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp28P10078 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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