Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatspereP0DP43 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms