Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3cP0DOY1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms