Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf1P09925 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms