Protein–RNA interactions for Protein: P07310

Ckm, Creatine kinase M-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkmP07310 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkmP07310 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkmP07310 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CkmP07310 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CkmP07310 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CkmP07310 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkmP07310 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms