Protein–RNA interactions for Protein: P07147

Tyrp1, 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyrp1P07147 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyrp1P07147 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms