Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06336 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06336 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06336 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06336 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06336 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06336 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06336 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06336 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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P06336 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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P06336 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06336 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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