Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms