Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01809 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01809 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01809 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01809 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01809 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01809 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01809 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01809 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01809 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01809 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01809 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01809 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01809 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01809 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01809 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01809 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01809 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01809 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01809 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01809 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01809 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01809 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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