Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01738 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01738 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01738 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms