Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01678 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01678 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01678 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01678 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01678 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01678 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01678 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01678 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms