Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01676 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01676 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01676 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01676 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01676 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01676 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01676 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01676 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms