Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01668 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01668 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01668 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01668 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01668 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01668 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01668 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01668 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms