Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01664 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01664 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01664 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01664 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01664 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01664 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms