Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01641 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01641 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01641 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01641 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01641 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01641 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01641 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01641 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01641 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01641 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01641 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01641 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01641 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01641 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01641 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01641 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01641 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01641 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms