Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopeO89079 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopeO89079 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopeO89079 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CopeO89079 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CopeO89079 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CopeO89079 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CopeO89079 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CopeO89079 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CopeO89079 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CopeO89079 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CopeO89079 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms