Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ShdO88834 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ShdO88834 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShdO88834 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShdO88834 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms