Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CntfrO88507 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CntfrO88507 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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CntfrO88507 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CntfrO88507 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CntfrO88507 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CntfrO88507 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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