Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme6O88425 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme6O88425 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme6O88425 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms