Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AvilO88398 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AvilO88398 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AvilO88398 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AvilO88398 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AvilO88398 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms