Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CaskO70589 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CaskO70589 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CaskO70589 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms